Đặc điểm kháng colistin của các chủng Klebsiella pneumoniae phân lập từ các hộ chăn nuôi khu vực Nam Định năm 2023
Nội dung chính của bài viết
Tóm tắt
Klebsiella pneumoniae là một trong các tác nhân hàng đầu gây nhiễm trùng cơ hội trên người, với khả năng đề kháng nhiều loại kháng sinh, được tìm thấy trong môi trường, hệ đường ruột của người, động vật. Gene đề kháng colistin mcr-1 và mcr-3 là hai biến thể lưu hành phổ biến ở Việt Nam. Tuy nhiên, những hiểu biết về đặc điểm kháng colistin của các chủng K. pneumoniae được phân lập từ cộng đồng còn nhiều hạn chế. Chúng tôi tiến hành nghiên cứu 200 chủng K. pneumoniae phân lập từ 150 mẫu phân động vật, 234 mẫu môi trường, 199 mẫu phân trẻ em để xác định kiểu hình kháng colistin và tỷ lệ mang gene mcr-1 và mcr-3. Tỷ lệ K. pneumoniae biểu hiện kiểu hình kháng colistin là 22,9% (phân động vật), 7,6% (môi trường), 0% (phân trẻ em). Giá trị MIC50 và MIC90 của colistin lần lượt là 1µg/ml và 8µg/ml. Tỷ lệ K. pneumoniae mang gene mcr-1 là 6,5%, có đồng thời hai gene mcr-1 và mcr-3 là 2,0%, không có chủng mang chỉ một gene mcr-3. Nghiên cứu cho thấy các chủng K. pneumoniae mang gene mcr-1, mcr-3 lưu hành chủ yếu trong quần thể động vật và môi trường.
Chi tiết bài viết
Từ khóa
K. pneumoniae, đề kháng colistin, mcr-1, mcr-3
Tài liệu tham khảo
2. Ah YM, Kim AJ, Lee JY. Colistin resistance in Klebsiella pneumoniae. Int J Antimicrob Agents. 2014;44(1):8-15. doi:10.1016/j.ijantimicag.2014.02.016
3. Liu JH, Liu YY, Shen YB, et al. Plasmid-mediated colistin-resistance genes: mcr. Trends Microbiol. 2024;32(4):365-378. doi:10.1016/j.tim.2023.10.006
4. Dalmolin T V, De Lima-Morales D, Barth AL. Plasmid-Mediated Colistin Resistance: What Do We Know? Vol 1.; 2018. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/
5. Bich VTN, Thanh LV, Thai PD, et al. An exploration of the gut and environmental resistome in a community in northern Vietnam in relation to antibiotic use. Antimicrob Resist Infect Control. 2019;8(1). doi:10.1186/s13756-019-0645-9
6. ECDC/EFSA/EMA second joint report on the integrated analysis of the consumption of antimicrobial agents and occurrence of antimicrobial resistance in bacteria from humans and food-producing animals: Joint Interagency Antimicrobial Consumption and Resistance Analysis (JIACRA) Report. EFSA Journal. 2017;15(7). doi:10.2903/j.efsa.2017.4872
7. Antimicrobial consumption and resistance in bacteria from humans and food-producing animals: Fourth joint inter-agency report on integrated analysis of antimicrobial agent consumption and occurrence of antimicrobial resistance in bacteria from humans and food-producing animals in the EU/EEA JIACRA IV – 2019−2021. EFSA Journal. 2024;22(2). doi:10.2903/j.efsa.2024.8589
8. Binsker U, Käsbohrer A, Hammerl JA. Global colistin use: A review of the emergence of resistant Enterobacterales and the impact on their genetic basis. FEMS Microbiol Rev. 2022;46(1). doi:10.1093/femsre/fuab049
9. Luu QH, Nguyen TLA, Pham TN, et al. Antimicrobial use in household, semi-industrialized, and industrialized pig and poultry farms in Viet Nam. Prev Vet Med. 2021;189:105292. doi:10.1016/j.prevetmed.2021.105292
10. Carrique-Mas JJ, Trung N V, Hoa NT, et al. Antimicrobial Usage in Chicken Production in the Mekong Delta of Vietnam. Zoonoses Public Health. 2015;62(s1):70-78. doi:10.1111/zph.12165
11. Sở Nông Nghiệp và Phát triển nông thôn tỉnh Nam Định. Tiềm năng và cơ hội đầu tư vào nông nghiệp – nông thôn Nam Định. https://sonnptnt.namdinh.gov.vn/xuc-tien-dau-tu/tiem-nang-va-co-hoi-dau-tu-vao-nong-nghiep-nong-thon-nam-dinh-77786.
12. Nguyễn Thị Ngọc. Nam Định: Cải thiện chất lượng môi trường trong chăn nuôi. Tạp chí Môi trường, số 11/2018. 2018;1(11).
13. Rhouma M, Beaudry F, Thériault W, et al. Colistin in pig production: Chemistry, mechanism of antibacterial action, microbial resistance emergence, and one health perspectives. Front Microbiol. 2016;7(NOV). doi:10.3389/fmicb.2016.01789
14. Clinical and Laboratory Standards Institute, Weinstein MP. M07, Methods for Dilution Antimicrobial Susceptibility Tests for Bacteria That Grow Aerobically. 11th ed. CLSI; 2018.
15. Clinical and Laboratory Standards Institute, James S. Lewis II. CLSI M100, Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing. 34th ed. CLSI; 2023.
16. Aslam B, Chaudhry TH, Arshad MI, et al. Distribution and genetic diversity of multi-drug-resistant Klebsiella pneumoniae at the human–animal–environment interface in Pakistan. Front Microbiol. 2022;13. doi:10.3389/fmicb.2022.898248
17. Vu Thi Ngoc B, Le Viet T, Nguyen Thi Tuyet M, et al. Characterization of Genetic Elements Carrying mcr-1 Gene in Escherichia coli from the Community and Hospital Settings in Vietnam. Microbiol Spectr. 2022;10(1). doi:10.1128/spectrum.01356-21