Đặc điểm sinh học phân tử và mối liên quan với lâm sàng của typ Dengue 1 gây dịch năm 2017
Nội dung chính của bài viết
Tóm tắt
Tìm hiểu một số đặc điểm sinh học phân tử và mối liên quan với mức độ lâm sàng của DEN - 1 gây dịch năm 2017. Nghiên cứu đa trung tâm, từ 07 - 12/2017, gồm 188 bệnh nhân sốt xuất huyết dengue (SXHD) ≥ 6 tuổi có xét nghiệm PCR (+) với DEN - 1, tại bệnh viện Bệnh Nhiệt đới Trung ương và bệnh viện Bệnh Nhiệt đới, TP.Hồ Chí Minh. Đã giải mã thành công hệ gen của 55 chủng DEN - 1 gây dịch năm 2017. Hệ gen gồm 10.697 nucleotide, mã hóa một khung đọc mở gồm 3392 axit min. Các chủng DEN - 1 đều thuộc genotype 1 và có mức độ biến đổi axit amin cao ở hầu hết các gen (4,6%). Nguồn gốc vẫn là chủng DENV phân bố tại Việt Nam trước đây. Có mối liên quan giữa bốn vị trí biến đổi axit amin 67, 126 (NS2A); 94 (NS2B) và 821 (NS5) với SXHD nặng. Nghiên cứu làm sáng tỏ nguồn gốc, sự biến đổi di truyền của các chủng DEN - 1 gây bệnh tại Việt Nam và mối liên quan giữa các vị trí thay thế axit amin với mức độ lâm sàng.
Chi tiết bài viết
Từ khóa
Hệ gen, dengue virus type 1 (DEN - 1), biến đổi axit amin.
Tài liệu tham khảo
2. Julien L. and Shee - Mei LoK. The Structural Biology of Dengue Virus. In: Duane J. Gubler, Eng E. Ooi, Subhash Vasudevan, Jeremy Farrar, Editor. Dengue and Dengue Hemorrhagic Fever. CPI Group Ltd, Croydon, CR0 4YY: Printed and bound in the UK. 2014; 365 - 376.
3. Tang Y, Rodpradit P, Chinnawirotpisan P, et al. Comparative analysis of full - length genomic sequences of 10 dengue serotype 1 viruses associated with different genotypes, epidemics, and disease severity isolated in Thailand over 22 years. Am J Trop Med Hyg. 2010; 83 (5):156 - 65.
4. Descloux E, Cao - Lormeau V. M, Roche C, De Lamballerie X. Dengue 1 diversity and microevolution, French Polynesia 2001 - 2006: connection with epidemiology and clinics. PLoS Negl Trop Dis. 2009; 3 (8). e493.
5. Bộ Y tế. Hướng dẫn chẩn đoán, điều trị sốt xuất huyết Dengue. Ban hành kèm theo Quyết định số 3705/QĐ - BYT ngày 22 tháng 08 năm 2019 của Bộ trưởng Bộ Y tế, 2019.
6. Đặng Thị Thúy, Annette Fox, Bùi Vũ Huy, et al. Đặc điểm lâm sàng bệnh sốt xuất huyết dengue theo các typ virus dengue gây bệnh. Tạp chí y hoc dự phong. 2013; 2 (137): 30 - 34.
7. Cao Minh Thắng, Vũ Thiên Thu Ngữ, Huỳnh Phương Thảo, et al. Giám sát vi rút học bệnh sốt xuất huyết dengue trong chương trình mục tiêu quốc gia phòng chống sốt xuất huyết dengue tại khu vực phía Nam Việt Nam trong giai đoạn 2005 - 2014. Tạp chí y hoc dự phong. 2015; Tập XXV, số 5 (165): 42 - 46.
8. Huong Van Nguyen PQTT, Nguyen TH, Vu GT, et al. Knowledge, Attitude and Practice about Dengue Fever among Patients Experiencing the 2017 Outbreak in Vietnam. Int J Environ Res Public Health. 2019; 16:976 - 88.
9. Keats J. J, Cuyugan L, Adkins J, Liang W. S. Whole Genome Library Construction for Next Generation Sequencing. Methods Mol Biol. 2018; 1706:151 - 161.
10. Nguyễn Mạnh Hùng, Trần Thị Ngọc Ánh, Nguyễn Thị Kiều Anh và cộng sự. Sự lưu hành và một số đặc điểm dịch tễ các týp vi rút dengue gây bệnh sốt xuất huyết tại hà nội, giai đoạn 2015 - 2017. Tạp chí Y học dự phòng. 2017; 28 (5): 88 - 96.
11. Benediktus Yohan, Puspa Wardhani, Hidayat Trimarsanto, et al. Genomic analysis of dengue virus serotype 1 (DENV‑1) genotypes from Surabaya, Indonesia. Virus Genes. 2018; 54 (3). doi: 10. 1007/s11262 - 018 - 1558 - z.
12. Costa R. L, Voloch C. M, Schrago C. G. Comparative evolutionary epidemiology of dengue virus serotypes. Infect Genet Evol. 2012; 12 (2): 309 - 14.
13. Vũ Thiên Thu Ngữ, Phạm Thị Thu Hằng, Hoàng Thị Như Đào và cộng sự. Phân tích di truyền của vi rút dengue lưu hành tại khu vực phía Nam Việt Nam năm 2014 - 2015. Tạp chí y học dự phòng. 2015; Tập XXV, số 5 (165): 47 - 53.
14. Rodriguez - Roche R, Blanc H, Bordería A. V, et al. Increasing Clinical Severity during a Dengue Virus Type 3 Cuban Epidemic: Deep Sequencing of Evolving Viral Populations. J Virol. 2016; 90 (9): 4320 - 4333.
15. Jiang L, Ma D, Ye C. , Et al. Molecular Characterization of Dengue Virus Serotype 2 Cosmospolitan Genotype From 2015 Dengue Outbreak in Yunnan, China. Front Cell Infect Microbiol. 2018; 8:219.