Article Sidebar

PDF (Tiếng Việt)
Published: 2021-05-25
Abstract Views: 495
Views PDF (Tiếng Việt): 422
DOI: https://doi.org/10.52852/tcncyh.v139i3.110
Issue
Vol. 139 No. 3 (2021)
Section
Các bài báo
How to Cite
Thúy, Đặng T. ., Duyệt, L. V. ., & Huy, B. V. . (2021). Molecular characteristics and relationship with clinical severity of dengue virus type 1 in the 2017 outbreak. Journal of Medical Research, 139(3), 108-116. https://doi.org/10.52852/tcncyh.v139i3.110

Molecular characteristics and relationship with clinical severity of dengue virus type 1 in the 2017 outbreak

Đặng Thị Thúy, Lê Văn Duyệt, Bùi Vũ Huy

Main Article Content

Abstract

This study was conducted to investigate some of the molecular characteristics and correlation with clinical severity of DEN - 1 strains in the 2017 outbreak. Multi - center study was implemented from July 2017 to December 2017 at the National Hospital for Tropical Diseases and Hospital for Tropical Diseases, Ho Chi Minh City on 188 dengue hemorrhagic fever patients ≥ 6 years old with PCR (+) with DEN - 1. Results showed that the genome of 55 strains of DEN - 1 causing the outbreak in 2017 was successfully decoded. Genome included 10,697 nucleotides, encoded an open reading frame for 3392 amino acid. DEN - 1 strains belonged to genotype 1 and had a high level of amino acid variation in most genes (4.6%). The genetic origin was still the strains that were reported previously in Vietnam. There was a relationship between the four amino acid substitutions 67, 126 (NS2A); 94 (NS2B) and 821 (NS5) with severe dengue hemorrhagic fever. In conclusion, research has showed the origin, genetic variation of the DEN - 1 strains in Vietnam and the relationship between amino acid substitutions with clinical levels.

Article Details

Keywords

Full - length genome, dengue virus type 1 (DEN - 1), genetic variants.

References

1. World Health Organization. Dengue: Guidelines for Diagnosis, Treatment, Prevention and Control. Geneva: New Edition. 2009.
2. Julien L. and Shee - Mei LoK. The Structural Biology of Dengue Virus. In: Duane J. Gubler, Eng E. Ooi, Subhash Vasudevan, Jeremy Farrar, Editor. Dengue and Dengue Hemorrhagic Fever. CPI Group Ltd, Croydon, CR0 4YY: Printed and bound in the UK. 2014; 365 - 376.
3. Tang Y, Rodpradit P, Chinnawirotpisan P, et al. Comparative analysis of full - length genomic sequences of 10 dengue serotype 1 viruses associated with different genotypes, epidemics, and disease severity isolated in Thailand over 22 years. Am J Trop Med Hyg. 2010; 83 (5):156 - 65.
4. Descloux E, Cao - Lormeau V. M, Roche C, De Lamballerie X. Dengue 1 diversity and microevolution, French Polynesia 2001 - 2006: connection with epidemiology and clinics. PLoS Negl Trop Dis. 2009; 3 (8). e493.
5. Bộ Y tế. Hướng dẫn chẩn đoán, điều trị sốt xuất huyết Dengue. Ban hành kèm theo Quyết định số 3705/QĐ - BYT ngày 22 tháng 08 năm 2019 của Bộ trưởng Bộ Y tế, 2019.
6. Đặng Thị Thúy, Annette Fox, Bùi Vũ Huy, et al. Đặc điểm lâm sàng bệnh sốt xuất huyết dengue theo các typ virus dengue gây bệnh. Tạp chí y hoc dự phong. 2013; 2 (137): 30 - 34.
7. Cao Minh Thắng, Vũ Thiên Thu Ngữ, Huỳnh Phương Thảo, et al. Giám sát vi rút học bệnh sốt xuất huyết dengue trong chương trình mục tiêu quốc gia phòng chống sốt xuất huyết dengue tại khu vực phía Nam Việt Nam trong giai đoạn 2005 - 2014. Tạp chí y hoc dự phong. 2015; Tập XXV, số 5 (165): 42 - 46.
8. Huong Van Nguyen PQTT, Nguyen TH, Vu GT, et al. Knowledge, Attitude and Practice about Dengue Fever among Patients Experiencing the 2017 Outbreak in Vietnam. Int J Environ Res Public Health. 2019; 16:976 - 88.
9. Keats J. J, Cuyugan L, Adkins J, Liang W. S. Whole Genome Library Construction for Next Generation Sequencing. Methods Mol Biol. 2018; 1706:151 - 161.
10. Nguyễn Mạnh Hùng, Trần Thị Ngọc Ánh, Nguyễn Thị Kiều Anh và cộng sự. Sự lưu hành và một số đặc điểm dịch tễ các týp vi rút dengue gây bệnh sốt xuất huyết tại hà nội, giai đoạn 2015 - 2017. Tạp chí Y học dự phòng. 2017; 28 (5): 88 - 96.
11. Benediktus Yohan, Puspa Wardhani, Hidayat Trimarsanto, et al. Genomic analysis of dengue virus serotype 1 (DENV‑1) genotypes from Surabaya, Indonesia. Virus Genes. 2018; 54 (3). doi: 10. 1007/s11262 - 018 - 1558 - z.
12. Costa R. L, Voloch C. M, Schrago C. G. Comparative evolutionary epidemiology of dengue virus serotypes. Infect Genet Evol. 2012; 12 (2): 309 - 14.
13. Vũ Thiên Thu Ngữ, Phạm Thị Thu Hằng, Hoàng Thị Như Đào và cộng sự. Phân tích di truyền của vi rút dengue lưu hành tại khu vực phía Nam Việt Nam năm 2014 - 2015. Tạp chí y học dự phòng. 2015; Tập XXV, số 5 (165): 47 - 53.
14. Rodriguez - Roche R, Blanc H, Bordería A. V, et al. Increasing Clinical Severity during a Dengue Virus Type 3 Cuban Epidemic: Deep Sequencing of Evolving Viral Populations. J Virol. 2016; 90 (9): 4320 - 4333.
15. Jiang L, Ma D, Ye C. , Et al. Molecular Characterization of Dengue Virus Serotype 2 Cosmospolitan Genotype From 2015 Dengue Outbreak in Yunnan, China. Front Cell Infect Microbiol. 2018; 8:219.