Mức độ nhạy cảm với kháng sinh và một số kiểu gen đề kháng betalactam của K. aerogenes phân lập tại Bệnh viện Bạch Mai
Nội dung chính của bài viết
Tóm tắt
Nghiên cứu được thực hiện trên 193 chủng phân lập từ các loại bệnh phẩm tại bệnh viện Bạch Mai từ tháng 1 - 12/2023 nhằm xác định mức độ nhạy cảm với các kháng sinh và xác định năm kiểu gen mã hoá carbapenemase, sáu kiểu gen mã hoá ESBL bằng phương pháp PCR. Kết quả K. aerogenes phân lập được nhiều nhất từ bệnh phẩm dịch tiết hô hấp (79,3%). 150 chủng có kiểu hình kháng carbapenem,trong đó kiểu gen mã hoá ESBL thường gặp nhất là blaTEM, blaCTX-M1, blaOXA-1 (hơn 40%), kiểu gen mã hoá carbapenemase thường gặp nhất là blaOXA-48 (70%). Tỉ lệ các chủng mang kiểu gen mã hoá carbapenemase phối hợp blaNDM + blaOXA-48, blaKPC + blaOXA-48 lần lượt là 17,3%, 3,3%. K. aerogenes đã đề kháng hầu hết kháng sinh hay được sử dụng, chỉ còn nhạy cảm với một số kháng sinh như ceftazidime/avibactam (67,8%), trimethoprim/sulfamethoxazole(41,4%), amikacin (27,9%), gentamycin(18,1%) nồng độ ức chế tối thiểu của fosfomycin (≤ 16 µg/mL) là 61,1%. Dữ liệu cung cấp cơ sở cho bác sỹ lâm sàng lựa chọn kháng sinh điều trị khi chưa có kết quả kháng sinh đồ.
Chi tiết bài viết
Từ khóa
K. aerogenes, kiểu gen carbapenemase, ESBL, mức độ nhạy cảm kháng sinh
Tài liệu tham khảo
1. Baier - Grabner S, Equiluz-Bruck S, Endress D, et al. A Yersiniabactin-producing Klebsiella aerogenes Strain Causing an Outbreak in an Austrian Neonatal Intensive Care Unit. Pediatr Infect Dis J. 2022;41(7):593-599. doi: 10.1 097/I NF.00 0000 0000003553
2. Vargas JM, Moreno Mochi MP, Nuñez JM, et al. Emergence and clonal spread of KPC-2-producing clinical Klebsiella aerogenes isolates in a hospital from northwest Argentina. J Med Microbiol. 2023;72(1). doi: 10.1099/jmm.0.001635
3. Pan F, Xu Q, Zhang H. Emergence of NDM-5 Producing Carbapenem-Resistant Klebsiella aerogenes in a Pediatric Hospital in Shanghai, China. Front Public Health. 2021;9:621527. doi: 10.3389/fpubh.2021.621527
4. Hao M, Shen Z, Ye M, et al. Outbreak Of Klebsiella pneumoniae Carbapenemase-Producing Klebsiella aerogenes Strains In A Tertiary Hospital In China. Infect Drug Resist. 2019;12:3283-3290. doi: 10.2147/IDR.S221279
5. Chou A, Sucgang R, Hamill RJ, et al. Mortality difference from Klebsiella aerogenes vs Enterobacter cloacae bloodstream infections. Access Microbiol. 2023;5(2):acmi000421. doi: 10.1099/acmi.0.000421
6. Peykov S, Stratev A, Kirov B, et al. First detection of a colistin-resistant Klebsiella aerogenes isolate from a critically ill patient with septic shock in Bulgaria. Acta Microbiol Immunol Hung. 2022;69(3):209-214. doi: 10.1556/0 30.2022.01833
7. Wesevich A, Sutton G, Ruffin F, et al. Newly Named Klebsiella aerogenes (formerly Enterobacter aerogenes) Is Associated with Poor Clinical Outcomes Relative to Other Enterobacter Species in Patients with Bloodstream Infection. J Clin Microbiol. 2020; 58(9):e00582-20. doi: 10.1128/JCM.00582-20
8. Kamio K, Espinoza JL. The Predominance of Klebsiella aerogenes among Carbapenem-Resistant Enterobacteriaceae Infections in Japan. Pathogens. 2022;11(7):722. doi: 10.3390/ pathogens11070722
9. Boattini M, Bianco G, Llorente LI, et al. Enterobacterales carrying chromosomal AmpC β-lactamases in Europe (EuESCPM): Epidemiology and antimicrobial resistance burden from a cohort of 27 hospitals, 2020-2022. Int J Antimicrob Agents. 2024;63(5):107115. doi:10.1016/j.ijantimicag.2024.107115https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38367844/
10. Phạm Hồng Nhung, Nguyễn Tuấn Linh. Nhiễm trùng do các trực khuẩn Gram âm thường gặp tại Trung tâm Hồi sức tích cực, Bệnh viện Bạch Mai năm 2023. Tạp chí Nghiên cứu Y học. 2024;178(5):43-51. https:// doi.org /10.528 52/tcncyh.v178i5.2401
11. Quế Anh Trâm, Nguyễn Thị Hà. Một số đặc điểm vi khuẩn ở người bệnh viêm phổi liên quan thở máy tại khoa chống độc bệnh viện Hữu Nghị đa khoa Nghệ An. Tạp chí Y học Việt Nam. 2023;530(1). https://doi.org/10.51298/vmj.v530i1.6599
12. Davin-Regli A, Pagès JM. Enterobacter aerogenes and Enterobacter cloacae; versatile bacterial pathogens confronting antibiotic treatment. Front Microbiol. 2015;6:392. doi: 10.3389/fmicb.2015.00392
13. Pranita D Tamma, Emily L Heil, Julie Ann Justo, et al. Infectious Diseases Society of America Antimicrobial-Resistant Treatment Guidance: Gram-Negative Bacterial Infections. Infectious Diseases Society of America 2024; Version 4.0 https://www.idsociety.org/practice-guideline/amr-guidance/.
14. CLSI. Performance Standards for antimicrobial susceptibility testing. 33th Ed. CLSI suplement M100. Clinical and Laboratory Standards Institute. 2023.
15. Doyle D, Peirano G, Lascols C, et al. Laboratory detection of Enterobacteriaceae that produce carbapenemases. Journal of clinical microbiology. 2012;50(12):3877-3880 doi: 10.1128/JCM.02117-12
16. Dallenne C, Da Costa A, Decré D, et al. Development of a set of multiplex PCR assays for the detection of genes encoding important β-lactamases in Enterobacteriaceae. J Antimicrob Chemother. 2010;65(3):490-495 doi:10.1 093/j ac/dkp498
17. Rasmussen BA, Bush K. Carbapenem-hydrolyzing beta-lactamases. Antimicrobial agents and chemotherapy. 1997;41(2):223. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC163693/
18. Kowalska-Krochmal B, Mączyńska B, Rurańska-Smutnicka D, et al. Assessment of the Susceptibility of Clinical Gram-Negative and Gram-Positive Bacterial Strains to Fosfomycin and Significance of This Antibiotic in Infection Treatment. Pathogens. 2022;11(12):1441. Published 2022 Nov 30. doi: 10.3390/pathogens11121441
19. Boyd SE, Holmes A, Peck R, et al. OXA-48-Like β-Lactamases: Global Epidemiology, Treatment Options, and Development Pipeline. Antimicrob Agents Chemother. 2022;66(8):e0021622. doi: 10.1128/aac.00216-22
20. Jacoby GA. AmpC beta-lactamases. Clin Microbiol Rev. 2009;22(1):161-182. doi:10.1128/ CMR.00036-08
21. Pranita D Tamma, Emily L Heil, Julie Ann Justo, et al. Infectious Diseases Society of America 2024 Guidance on the Treatment of Antimicrobial-Resistant Gram-Negative Infections. Clinical Infectious Diseases. 2024;ciae403. https://doi.org/10.1093/cid/ciae 403
22. Tze-Peng Lim, Jocelyn Qi-Min Teo, Audrey Wei-Ling Goh, et al. In Vitro Pharmacodynamics of Fosfomycin against Carbapenem-Resistant Enterobacter cloacae and Klebsiella aerogenes. Antimicrob Agents Chemother. 2020;64(9):e00536-20. doi: 10.1128/AAC.00536-20. https://doi. org/ 10. 1128/aac.00536-20
23. Bakthavatchalam Y D, Shankar A, Muthuirulandi Sethuvel D P, et al. Synergistic Activity of fosfomycin–meropenem and fosfomycin–colistin Against Carbapenem Resistant Klebsiella Pneumoniae: an In Vitro Evidence. Future Science OA. 2020;6(4):1. https://doi.org/10.2144/fsoa-2019-0074
24. Takei K, Ogawa M, Sakata R, et al. Molecular Epidemiology of Carbapenem-Resistant Klebsiella aerogenes in Japan. Int J Mol Sci. 2024;25(8):4494. Published 2024 Apr 19. doi: 10.3390/ijms25084494
25. Merhi G, Amayri S, Bitar I, et al. Whole Genome-Based Characterization of Multidrug Resistant Enterobacter and Klebsiella aerogenes Isolates from Lebanon. Microbiol Spectr. 2023;11(1):e0291722. doi: 10.1128/spectrum.02917-22
26. Nguyễn Quang Toàn, Nguyễn Thị Kim Phương, Bùi Tiến Sỹ, và cs. Đánh giá hiệu quả một số biện pháp can thiệp nhằm làm giảm nhiễm khuẩn bệnh viện tại các đơn vị Hồi sức tích cực, Bệnh viện Trung ương Quân đội 108. Journal of 108 - Clinical Medicine and Phamarcy. 2024. https://doi.org/10.52389/ydls.v0i0.2296
27. H′Nương Nie, Phạm Hồng Nhung, Trần Minh Châu, et al. Xác định kiểu gen mã hóa carbapenemase của các chủng Klebsiella pneumoniae sinh carbapenemase chưa phân nhóm được bằng hệ thống Phoenix M50. Tạp chí Nghiên cứu Y học. 2023;160(12V1):1-7. https://doi.org/10.52 852/tcncy h.v160i12V1.1137
2. Vargas JM, Moreno Mochi MP, Nuñez JM, et al. Emergence and clonal spread of KPC-2-producing clinical Klebsiella aerogenes isolates in a hospital from northwest Argentina. J Med Microbiol. 2023;72(1). doi: 10.1099/jmm.0.001635
3. Pan F, Xu Q, Zhang H. Emergence of NDM-5 Producing Carbapenem-Resistant Klebsiella aerogenes in a Pediatric Hospital in Shanghai, China. Front Public Health. 2021;9:621527. doi: 10.3389/fpubh.2021.621527
4. Hao M, Shen Z, Ye M, et al. Outbreak Of Klebsiella pneumoniae Carbapenemase-Producing Klebsiella aerogenes Strains In A Tertiary Hospital In China. Infect Drug Resist. 2019;12:3283-3290. doi: 10.2147/IDR.S221279
5. Chou A, Sucgang R, Hamill RJ, et al. Mortality difference from Klebsiella aerogenes vs Enterobacter cloacae bloodstream infections. Access Microbiol. 2023;5(2):acmi000421. doi: 10.1099/acmi.0.000421
6. Peykov S, Stratev A, Kirov B, et al. First detection of a colistin-resistant Klebsiella aerogenes isolate from a critically ill patient with septic shock in Bulgaria. Acta Microbiol Immunol Hung. 2022;69(3):209-214. doi: 10.1556/0 30.2022.01833
7. Wesevich A, Sutton G, Ruffin F, et al. Newly Named Klebsiella aerogenes (formerly Enterobacter aerogenes) Is Associated with Poor Clinical Outcomes Relative to Other Enterobacter Species in Patients with Bloodstream Infection. J Clin Microbiol. 2020; 58(9):e00582-20. doi: 10.1128/JCM.00582-20
8. Kamio K, Espinoza JL. The Predominance of Klebsiella aerogenes among Carbapenem-Resistant Enterobacteriaceae Infections in Japan. Pathogens. 2022;11(7):722. doi: 10.3390/ pathogens11070722
9. Boattini M, Bianco G, Llorente LI, et al. Enterobacterales carrying chromosomal AmpC β-lactamases in Europe (EuESCPM): Epidemiology and antimicrobial resistance burden from a cohort of 27 hospitals, 2020-2022. Int J Antimicrob Agents. 2024;63(5):107115. doi:10.1016/j.ijantimicag.2024.107115https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38367844/
10. Phạm Hồng Nhung, Nguyễn Tuấn Linh. Nhiễm trùng do các trực khuẩn Gram âm thường gặp tại Trung tâm Hồi sức tích cực, Bệnh viện Bạch Mai năm 2023. Tạp chí Nghiên cứu Y học. 2024;178(5):43-51. https:// doi.org /10.528 52/tcncyh.v178i5.2401
11. Quế Anh Trâm, Nguyễn Thị Hà. Một số đặc điểm vi khuẩn ở người bệnh viêm phổi liên quan thở máy tại khoa chống độc bệnh viện Hữu Nghị đa khoa Nghệ An. Tạp chí Y học Việt Nam. 2023;530(1). https://doi.org/10.51298/vmj.v530i1.6599
12. Davin-Regli A, Pagès JM. Enterobacter aerogenes and Enterobacter cloacae; versatile bacterial pathogens confronting antibiotic treatment. Front Microbiol. 2015;6:392. doi: 10.3389/fmicb.2015.00392
13. Pranita D Tamma, Emily L Heil, Julie Ann Justo, et al. Infectious Diseases Society of America Antimicrobial-Resistant Treatment Guidance: Gram-Negative Bacterial Infections. Infectious Diseases Society of America 2024; Version 4.0 https://www.idsociety.org/practice-guideline/amr-guidance/.
14. CLSI. Performance Standards for antimicrobial susceptibility testing. 33th Ed. CLSI suplement M100. Clinical and Laboratory Standards Institute. 2023.
15. Doyle D, Peirano G, Lascols C, et al. Laboratory detection of Enterobacteriaceae that produce carbapenemases. Journal of clinical microbiology. 2012;50(12):3877-3880 doi: 10.1128/JCM.02117-12
16. Dallenne C, Da Costa A, Decré D, et al. Development of a set of multiplex PCR assays for the detection of genes encoding important β-lactamases in Enterobacteriaceae. J Antimicrob Chemother. 2010;65(3):490-495 doi:10.1 093/j ac/dkp498
17. Rasmussen BA, Bush K. Carbapenem-hydrolyzing beta-lactamases. Antimicrobial agents and chemotherapy. 1997;41(2):223. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC163693/
18. Kowalska-Krochmal B, Mączyńska B, Rurańska-Smutnicka D, et al. Assessment of the Susceptibility of Clinical Gram-Negative and Gram-Positive Bacterial Strains to Fosfomycin and Significance of This Antibiotic in Infection Treatment. Pathogens. 2022;11(12):1441. Published 2022 Nov 30. doi: 10.3390/pathogens11121441
19. Boyd SE, Holmes A, Peck R, et al. OXA-48-Like β-Lactamases: Global Epidemiology, Treatment Options, and Development Pipeline. Antimicrob Agents Chemother. 2022;66(8):e0021622. doi: 10.1128/aac.00216-22
20. Jacoby GA. AmpC beta-lactamases. Clin Microbiol Rev. 2009;22(1):161-182. doi:10.1128/ CMR.00036-08
21. Pranita D Tamma, Emily L Heil, Julie Ann Justo, et al. Infectious Diseases Society of America 2024 Guidance on the Treatment of Antimicrobial-Resistant Gram-Negative Infections. Clinical Infectious Diseases. 2024;ciae403. https://doi.org/10.1093/cid/ciae 403
22. Tze-Peng Lim, Jocelyn Qi-Min Teo, Audrey Wei-Ling Goh, et al. In Vitro Pharmacodynamics of Fosfomycin against Carbapenem-Resistant Enterobacter cloacae and Klebsiella aerogenes. Antimicrob Agents Chemother. 2020;64(9):e00536-20. doi: 10.1128/AAC.00536-20. https://doi. org/ 10. 1128/aac.00536-20
23. Bakthavatchalam Y D, Shankar A, Muthuirulandi Sethuvel D P, et al. Synergistic Activity of fosfomycin–meropenem and fosfomycin–colistin Against Carbapenem Resistant Klebsiella Pneumoniae: an In Vitro Evidence. Future Science OA. 2020;6(4):1. https://doi.org/10.2144/fsoa-2019-0074
24. Takei K, Ogawa M, Sakata R, et al. Molecular Epidemiology of Carbapenem-Resistant Klebsiella aerogenes in Japan. Int J Mol Sci. 2024;25(8):4494. Published 2024 Apr 19. doi: 10.3390/ijms25084494
25. Merhi G, Amayri S, Bitar I, et al. Whole Genome-Based Characterization of Multidrug Resistant Enterobacter and Klebsiella aerogenes Isolates from Lebanon. Microbiol Spectr. 2023;11(1):e0291722. doi: 10.1128/spectrum.02917-22
26. Nguyễn Quang Toàn, Nguyễn Thị Kim Phương, Bùi Tiến Sỹ, và cs. Đánh giá hiệu quả một số biện pháp can thiệp nhằm làm giảm nhiễm khuẩn bệnh viện tại các đơn vị Hồi sức tích cực, Bệnh viện Trung ương Quân đội 108. Journal of 108 - Clinical Medicine and Phamarcy. 2024. https://doi.org/10.52389/ydls.v0i0.2296
27. H′Nương Nie, Phạm Hồng Nhung, Trần Minh Châu, et al. Xác định kiểu gen mã hóa carbapenemase của các chủng Klebsiella pneumoniae sinh carbapenemase chưa phân nhóm được bằng hệ thống Phoenix M50. Tạp chí Nghiên cứu Y học. 2023;160(12V1):1-7. https://doi.org/10.52 852/tcncy h.v160i12V1.1137