1. Xác định biến thể gen liên quan đến kiểu hình ở trẻ em mắc bệnh tim bẩm sinh một tâm thất chức năng
Nội dung chính của bài viết
Tóm tắt
Bệnh tim bẩm sinh một tâm thất chức năng (FSV) là một bệnh tim bẩm sinh (CHD) phức tạp bao gồm nhiều khiếm khuyết có mức độ di truyền tương đối cao và nguy cơ tái phát ở anh chị em ruột. Nguyên nhân đa yếu tố của FSV đặt ra thách thức trong việc xác định rõ ràng các yếu tố gây bệnh cụ thể và lập kế hoạch can thiệp điều trị hiệu quả. Giải trình tự WES ngày càng được áp dụng trong nghiên cứu để xác định các biến thể gen liên quan đến các bệnh di truyền, đặc biệt là những bệnh có cơ chế di truyền phức tạp như FSV. Trong nghiên cứu này, chúng tôi đã sử dụng giải trình tự WES để xác định các biến thể trong các gen có liên quan ở những người bệnh mắc FSV. 55 biến thể trong 28 gen liên quan đến CHD (trong đó có 16 gen liên quan đến dị tật tim nghiêm trọng bao gồm BMP4, COL11A1, ELN, EOGT, HSPG2, KMT2D, LRP2, MYBPC3, MYH6, MYH7, NFATC1, NIPBL, NOTCH1, SEMA3C, TBX2, USH2A) đã được xác định và đánh giá bằng phần mềm để dự đoán tác động của các biến thể, kết quả cho thấy đây là các biến thể gây bệnh ở người bệnh. Kết quả nghiên cứu đóng góp các thông tin hữu ích vào sự hiểu biết chung về nguyên nhân gây bệnh và cung cấp cơ sở khoa học cho các bác sĩ lâm sàng trong chẩn đoán, điều trị và tư vấn di truyền cho người bệnh và gia đình họ.
Chi tiết bài viết
Từ khóa
Bệnh tim bẩm sinh (CHD), Bệnh tim một tâm thất chức năng (FSV), Biến thể gen, Giải trình tự toàn bộ vùng gen mã hóa (WES), người bệnh Việt Nam
Tài liệu tham khảo
2. Benjamin EJ, Virani SS, Callaway CW, et al. Heart disease and stroke statistics-2018 update: a report from the American Heart Association. Circulation. 2018; 137:e67–e92. doi:10.1161/CIR.000000000000055.
3. Homsy J, Zaidi S, Shen Y, et al. De novo mutations in congenital heart disease with neurodevelopmental and other congenital anomalies. Science. 2015; 350: 1262–1266. doi:10.1126/science.aac9396.
4. Glessner JT, Bick AG, Ito K, et al., Increased frequency of de novo copy number variants in congenital heart disease by integrative analysis of single nucleotide polymorphism array and exome sequence data. Circ. Res. 2014; 115: 884–896. doi:10.1161/CIRCRESAHA.115.304458.
5. Kim DS, Kim JH, Burt AA, et al. Burden of potentially pathologic copy number variants is higher in children with isolated congenital heart disease and significantly impairs covariate-adjusted transplant-free survival. J. Thorac. Cardiovasc. Surg. 2016; 151: 1147–1151. doi:10.1016/j.jtcvs.2015.09.136.
6. Qian B, Mo R, Da M, et al. Common variations in BMP4 confer genetic susceptibility to sporadic congenital heart disease in a Han Chinese population. Pediatr. Cardiol. 2014; 35: 1442–1447. doi:10.1007/s00246-014-0951-1.
7. Sticchi E, De Cario R, Magi A., et al. Bicuspid aortic valve: Role of multiple gene variants in influencing the clinical phenotype. Bio. Med. Res. Int. 2018; 8386123. doi:10.1155/2018/8386123.
8. Spielmann M, Miller G, Oprea TI, et al. Extensive identification of genes involved in congenital and structural heart disorders and cardiomyopathy. Nat. Cardiovasc. Res. 2022; 1: 157–173. doi:10.1038/s44161-022-00018-8.
9. Tang CSM, Mononen M, Lam WY, et al. Sequencing of a Chinese tetralogy of Fallot cohort reveals clustering mutations in myogenic heart progenitors. JCI Insight. 2022; 7(2): e152198. doi:10.1172/jci.insight.152198.
10. Yasuhara J, Garg V. Genetics of congenital heart disease: a narrative review of recent advances and clinical implications. Transl. Pediatr. 2021; 10(9): 2366–2386. doi:10.21037/tp-21-297.
11. Pierpont ME, Brueckner M, Chung WK, et al. American Heart Association Council on Cardiovascular Disease in the Young; Council on Cardiovascular and Stroke Nursing; Council on Genomic and Precision Medicine. Genetic basis for congenital heart disease: revisited: a scientific statement from the American Heart Association. Circulation. 2018; 138: e653–e711. [Erratum in Circulation 138: e73, 2018]. doi:10.1161/CIR.0000000000000608.
12. Xu J, Wu Q, Wang L, et al. Next-generation sequencing identified genetic variations in families with fetal non-syndromic atrioventricular septal defects. Int. J. Clin. Exp. Pathol. 2018; 11(7): 3732–3743. PMID:31949757.
13. Zhao X, Hou C, Xiao T, et al. An interesting Mybpc3 heterozygous mutation associated with bicuspid aortic valve. Transl. Pediatr. 2020; 9(5): 610–618. doi:10.21037/tp-20-81.
14. Wu Y, Jin X, Zhang Y, et al. Genetic and epigenetic mechanisms in the development of congenital heart diseases. World Jnl. Ped. Surgery. 2021;4:e000196. doi:10.1136/wjps-2020-000196.
15. Li B, Li T, Pu T, et al. Genetic and functional analyses detect one pathological NFATC1 mutation in a Chinese tricuspid atresia family. Mol. Genet. Genomic. Med. 2021; 9:e1771. doi:10.1002/mgg3.1771.
16. Zhang Z, Xu K, Ji L, et al. A novel loss-of-function mutation in NRAP is associated with left ventricular non-compaction cardiomyopathy. Front. Cardiovasc. Med. 2023; 10:1097957. doi:10.3389/fcvm.2023.1097957.
17. Duran I, Tenney J, Warren CM, et al. NRP1 haploinsufficiency predisposes to the development of Tetralogy of Fallot. Am. J. Med. Genet. A. 2018; 176(3): 649–656. doi:10.1002/ajmg.a.38600.
18. Rakhmanov Y, Maltese PE, Zulian A, et al. Genetic testing for atrial septal defect. EuroBiotech J. 2018; 2(1): 45–47. doi:10.2478/ebtj-2018-0035.
19. Chen S, Jin Q, Hou S, et al. Identification of recurrent variants implicated in disease in bicuspid aortic valve patients through whole-exome sequencing. Human Genomics. 2022; 16:36. doi:10.1186/s40246-022-00405-z.
20. Nielsen AKM, Nyboe C, Ovesen ASL, et al. Mutation burden in patients with small unrepaired atrial septal defects. IJC Congenital Heart Disease. 2021; 4: 100164. doi:10.1016/j.ijcchd.2021.100164.
21. Loffredo CA, Chokkalingam A, Sill AM, et al. Prevalence of congenital cardiovascular malfor-mations among relatives of infants with hypoplastic left heart, coarctation of the aorta, and d-transposition of the great arteries. Am. J. Med. Genet. A. 2004; 124A: 225–230. doi:10.1002/ajmg.a.20366.